5つの究極のScientificLinuxディストリビューション

5つの究極のScientificLinuxディストリビューション

ポップクイズの時間:科学的なLinuxディストリビューションとは何ですか?





答えはかなり明白です。ほとんどのLinuxディストリビューションは汎用ですが、一部の特殊なディストリビューションには特定の種類のソフトウェアがバンドルされています。たとえば、メディアセンターのディストリビューション、コンピューターをマルチメディア制作スタジオに変えるディストリビューション、さらにはいくつかの宗教的なディストリビューションもあります。それを知っていても、科学的なLinuxディストリビューションが存在することは驚くべきことではありません。結局のところ、Linuxの歴史は研究所で始まり、今日ではLinuxは世界最大の研究機関のサーバーとワークステーションを支えています。





簡単に言えば、科学ディストリビューションは、さまざまな研究目的のためにプリインストールされたソフトウェアを提供します。もちろん、同じアプリをインストールすることで、通常のUbuntuを科学的なディストリビューションに変えることができますが、そのようなディストリビューションのポイントは、個々のアプリケーションを探すのを避けることです。代わりに、研究施設、教育機関、および学生や科学に興味のあるユーザーのパーソナルコンピューターにLinuxを展開するための迅速な方法を提供します。後者の場合は、考慮すべき5つの優れた科学ディストリビューションがあります。





1.1。 バイオLinux

この緑色のディストロは、バイオインフォマティクス(分子生物学と遺伝学をコンピューターサイエンスの統計と分析方法と組み合わせた学際的な分野)で働く科学者を対象としています。英国の環境オミクス合成センターで開発されたBio-Linuxは、英国水文学研究所(CEH)と自然環境研究会議(NERC)によってサポートされ、資金提供されています。

これは64ビットシステムでのみ利用可能なUbuntuベースのディストリビューションであり、デフォルトとしてUnityと軽量の代替としてMATEの2つのデスクトップ環境を提供します。最新バージョン(8.0.5)は、Ubuntu14.04コアのおかげで長期サポートを保証します。 Bio-Linux 8には、コマンドラインとグラフィックの両方で、文字通り何百ものバイオインフォマティクスツールが含まれています。あなたが始めるのを助けるために、Bio-Linuxは提供します PDFガイド



ソフトウェアのハイライト: Artemis、DNA配列ビューアおよび注釈アプリ。 Galaxy、ブラウザベースの生物医学研究プラットフォーム。 Fasta、DNAおよびタンパク質データベースの検索用。メスキート、進化生物学用。系統樹を描画するためのnjplot、および高分子を視覚化するためのRasmol。 UbuntuベースのシステムにBio-Linuxからパッケージをインストールしたい場合は、簡単にできます。 リポジトリを追加する

Bio-Linuxは 無料で利用可能 VirtualBoxで実行する場合は、ライブイメージおよびOVAファイルとして。





別: BioSLAXは、バイオインフォマティクスに焦点を当て、シンガポール国立大学で開発されたSlackwareベースの科学的ディストリビューションです。

2.2。 ポセイドンLinux

Bio-Linuxと同様に、Poseidon Linuxにも配色があります。それは、海洋の名前と一致する穏やかなブルーの色調です。ブランディングは、プロジェクトに取り組んでいる海洋学者に触発されましたが、PoseidonLinuxは科学の1つの分野だけのものではありません。代わりに、2Dおよび3Dの視覚化、遺伝学、プログラミングアプリから、統計、数値モデリング、マッピングをサポートするまで、幅広いツールを提供します。





Poseidon Linuxは、ブラジルのリオグランデ連邦大学とドイツのMARUM研究所の間の大西洋横断協力の結果です。現在の安定バージョン(4.0)は、Ubuntu 10.04に基づいているため、時代遅れになっています。ただし、Poseidon 5.0は開発中であり、長期サポート(Ubuntu 12.04に依存)とデフォルトのデスクトップ環境としてのUnityを約束します。Poseidon4.0に付属する古いGNOME2.30からのアップグレードを歓迎します。

ソフトウェアのハイライト: インタラクティブなグラフ作成とデータ分析のためのラボプロット。 QCAD、2D描画用。 3Dモデリング用のBlender、および完全な地理情報システムであるQGIS。

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あなたはできる PoseidonLinuxをダウンロードする 32ビット版と64ビット版の両方で無料。

別: 地理ツールとマッピングツールのみが必要な場合は、 OSGeo 、Open Source GeospatialFoundationのLubuntuベースの製品。

3. CAElinux [使用できなくなりました]

手がかりはその名のとおりです。CAEはComputer-AidedEngineeringの略であり、この科学的なディストリビューションは、CAD、モデリング、プロトタイピング、3D印刷、および物理シミュレーションを扱うすべての人に最適です。スイスで開発されたCAElinuxはXubuntu12.04に基づいており、64ビットシステムが必要です。 Xfce以外のデスクトップフレーバーは提供していませんが、ソフトウェアの選択は印象的です。

ソフトウェアのハイライト: Salome、3DCADおよびメッシュ用。 GMSH、ジオメトリモデリング用。 Scilab、数理計画法用。 Paraview、3D視覚化用。画像処理と分析用のImageJ、および複雑な物理モデル用のElmer。

CAElinuxは、Live DVDイメージとして無料で入手できます。または、物理的なコピーを手頃な価格で注文することもできます。

別: すべての高度なエンジニアリングソフトウェアが必要ではなく、3Dモデリングおよびアニメーションツールが必要な場合は、ArtistXを試してください。これについては詳しく説明します。

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四。 Scientific Linux

これらすべての* buntuベースのディストリビューションの後、ScientificLinuxは真のコンボブレーカーです。これはRedHat EnterpriseLinuxの再構築です。最新バージョン(7.1、コードネームNitrogen)は、64ビットシステム専用の3つのフレーバー(KDE、GNOME、IceWM)で最近リリースされました。ただし、ScientificLinuxを際立たせるのはその基盤だけではありません。科学ソフトウェアで溢れている他のディストリビューションとは異なり、ScientificLinuxは基本的なアプリのセットのみを提供します。なんて卑劣で誤解を招くディストリビューションでしょう。

まあ、そうではありません。実際、Scientific Linuxは、フェルミ国立加速器研究所と欧州原子核研究機構(CERN)の科学者によって開発されました。デフォルトでは多くの科学的アプリケーションを提供していませんが、リポジトリには数十がすぐに利用できます。コーデックとワイヤレスサポートをすぐに使用できるScientificLinuxは、いじくり回すことなくすべてが機能することが期待される科学環境に最適です。ユーザーは必要なソフトウェアのみをインストールできるため、開くことのないアプリでシステムが乱雑になることはありません。

ソフトウェアのハイライト: データベースおよびアプリケーション開発用のPostgreSQLおよびMySQL。 GNUEmacsテキストエディタ; Rプログラミング言語;システム分析と監視用のFrysk、および数式のプロット用のgnuplot。 (これらのアプリの一部はデフォルトではインストールされませんが、リポジトリから取得できることに注意してください。)

Scientific Linuxは、次のようにダウンロードできます。 ライブDVD画像

別: Scientific Linuxの開発者は、プロジェクトに基づいて「スピン」またはビルドを作成することを推奨しています。そのようなディストリビューションの1つは Fermi Linux ; 32ビットシステムでScientificLinuxを実行したい人にとっては、セキュリティに重点を置いた優れたオプションです。

5.5。 Fedora Scientific

このFedoraスピンは、高度に専門化されたLinuxディストリビューションと通常のLinuxディストリビューションの中間点を表しています。そのため、数値ベースの研究に少し傾いていますが、すべての科学的背景の研究者や学生にとっては素晴らしいことです。デフォルトのデスクトップ環境はKDEであり、FedoraScientificは32ビットアーキテクチャと64ビットアーキテクチャの両方で使用できます。これは、Fedora Science and TechnologySIGの支援を受けてAmitSahaによって開発されました。綺麗な オンラインドキュメント Fedora Scientificを紹介し、ソフトウェアの選択について説明します。

ソフトウェアのハイライト: Maxima、完全な代数スイート。 LaTeX、ドキュメントやプレゼンテーションを作成するため。 Mayavi、3Dデータの視覚化、およびバージョン管理の3つの要素(git、Mercurial、Subversion)。

Fedora Scientific Live DVDは、直接ダウンロードまたはトレントとしてダウンロードできます。

別: 数学に焦点を当てたユーザーフレンドリーな科学的ディストリビューションを探しているなら、MathbuntuはFedoraScientificの優れた代替品です。スタンドアロンディストリビューションとして、または現在のUbuntuインストール用のパッケージセットとして利用できます。

興味のある科学分野に関係なく、このリストから適切な分布を選択できるはずです。さて、そのポップクイズに戻りましょう— お気に入りの科学的なLinuxディストリビューションは何ですか?このリストに載せるに値する他の同様のディストリビューションに名前を付けることができますか? 宿題をして、コメントであなたの推薦を共有してください。

画像クレジット: 注目の画像Flickrを介したNOCのNagiosベースのモニタリングウォールドックランズボーイポセイドンのスクリーンショット 、CAElinuxスクリーンショット、 ウィキメディアコモンズ経由のScientificLinuxFedoraScientificのスクリーンショット。

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著者について Ivana Isadora Devcic(24の記事が公開されました)

Ivana Isadoraは、フリーランスのライター兼翻訳者であり、Linux愛好家であり、KDEファンの女の子です。彼女は無料のオープンソースソフトウェアをサポートおよび宣伝しており、常に新鮮で革新的なアプリを探しています。連絡方法をご覧ください ここ

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